注冊公司開發票是否違法，需根據具體場景和操作方式綜合判斷。發票作為稅務管理的重要憑證，其開具行為受到《中華人民共和國刑法》《中華人民共和國稅收征收管理法》及《中華人民共和國發票管理辦法》的嚴格規范。合法注冊的公司具備開票資格，但若違反稅法規定，則可能涉嫌行政違法或刑事犯罪。

一、合法開具發票的情形

根據《發票管理辦法》第十九條，公司銷售商品、提供服務或從事其他經營活動時，應當向付款方開具發票。合法開票需滿足以下條件：

1. 真實交易基礎
   發票內容必須與實際發生的交易一致，包括商品/服務名稱、數量、金額等要素。例如，某公司銷售一批價值10萬元的設備，按合同約定向買方開具對應金額的增值稅專用發票，屬于合法行為。

2. 符合經營范圍
   發票內容須在公司登記的經營范圍內。若某科技公司超越經營范圍違規開具建筑服務類發票，可能被稅務機關認定為虛開發票。

3. 按規定程序開具
   需通過稅務系統驗證的稅控設備開具，嚴禁手工填寫或偽造發票。例如，使用稅務UKey在線生成帶有防偽碼的電子發票，屬于合規操作。

二、違法開具發票的主要情形

根據《刑法》第205條及《發票管理辦法》第二十二條，以下行為屬于違法開票：

（一）虛開發票

1. 無真實交易的虛開
   典型場景包括：

   • 為幫助其他企業偷逃稅款，虛構交易開具發票（如A公司與B公司簽訂虛假采購合同，虛開500萬元增值稅專用發票）；
   • 利用空殼公司大量開具發票后走逃（如某公司注冊后無實際經營，半年內對外開具上億元發票并注銷）。

2. 變名虛開
   通過篡改貨物品名、抬高單價等方式虛增稅額。例如，某煤炭貿易公司將實際銷售的低稅率煤炭變更為高稅率化工產品開票，導致國家稅款損失。

3. 循環虛開
   多家關聯公司相互虛開形成閉環。如甲、乙、丙三家公司通過虛假購銷合同互相開票，虛抵進項稅額超過2000萬元。

（二）非法代開發票

未發生實際業務卻為他人代開發票。例如，某商貿公司以收取開票費為目的，為外部企業代開服裝類發票120萬元。

（三）違規開具發票

• 超經營范圍開票（如咨詢公司開具醫療器械銷售發票）；
• 使用作廢發票或私自印制發票；
• 開具金額、稅率等要素與真實交易不符的發票。

三、違法開票的法律后果

（一）行政責任

根據《發票管理辦法》第三十七條：

• 虛開金額1萬元以下：處5萬元以下罰款；
• 虛開金額超1萬元：處5萬-50萬元罰款；
• 沒收違法所得。
  典型案例：2025年杭州某企業因虛開普通發票380萬元，被稅務機關罰款25萬元并移送司法機關。

（二）刑事責任

依據《刑法》第205條及相關司法解釋：

1. 虛開增值稅專用發票
   • 稅款數額5萬元以上：處3年以下有期徒刑或拘役；
   • 稅款數額50萬元以上：處3-10年有期徒刑；
   • 稅款數額250萬元以上：處10年以上至無期徒刑。
     2025年江蘇虛開專票案中，主犯因虛開稅款金額逾900萬元，被判有期徒刑12年。

2. 虛開普通發票
   情節嚴重（如虛開100份以上或金額40萬元以上）：處2年以下有期徒刑；
   情節特別嚴重：處2-7年有期徒刑。

（三）連帶責任

受票方若明知發票虛開仍使用，可能被要求補繳稅款及滯納金。根據《國家稅務總局關于異常增值稅扣稅憑證管理等有關事項的公告》，對異常憑證的進項稅額需作轉出處理。例如，某制造企業接受虛開發票抵扣的80萬元進項稅被要求全額補繳。

四、風險防范建議

1. 建立交易真實性審查機制
   留存完整的合同、物流單據、資金流水等“三流一致”證據。某跨境電商企業通過區塊鏈技術固化交易數據，成功應對稅務稽查。

2. 定期開展稅務合規審計
   重點核查開票品目與經營范圍的匹配性。建議每季度抽查20%以上的發票開具記錄。

3. 警惕高風險業務模式
   對“富余票”“掛靠開票”“平進平出”等異常模式保持警覺。某物流公司因接受掛靠車輛虛開燃油費發票，被認定為共同犯罪。

4. 善用專業支持
   聘請稅務顧問設計交易結構，例如通過“合同分拆”方式合理降低單張發票金額，避免觸發風險預警指標。

合法注冊的公司具有開票資格，但發票開具必須嚴格遵循稅法規定。企業需強化內控管理，杜絕“以票沖賬”“買票抵稅”等違法行為。根據國家稅務總局數據，2025年全國查處虛開騙稅案件涉案金額超2000億元，表明監管力度持續加強。唯有堅持業務真實性原則，方能實現穩健經營。